MDACC-TC372-PDX-P1

Gene	Somatic Mutations	Classification	Type	VAF	Somatic Copy Number	CN status	Fusions
ABLIM1	p.E25*	Nonsense	SNP	0.525	2	-	ND
AC004080.3	-	-	-	-	0	Del	ND
AC012531.2	-	-	-	-	0	Del	ND
BCR	-	-	-	-	1	Loss	ND
GGTLC2	-	-	-	-	1	Loss	ND
GNAZ	-	-	-	-	1	Loss	ND
HOXA10	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA11	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA13	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA2	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA3	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA4	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA5	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA6	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA7	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXA9	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXB4	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXB5	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXB6	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXB7	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXB8	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXB9	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC10	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC11	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC12	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC13	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC4	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC5	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC6	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC8	-	-	-	-	0	Del	ND
HOXC9	-	-	-	-	0	Del	ND
IGHJ4	p.Y4D	Missense	SNP	1.000	ND	ND	ND
IGHV3-21	p.A80S	Missense	SNP	0.600	ND	ND	ND
IGLL5	-	-	-	-	1	Loss	ND
LCN2	p.S166L	Missense	SNP	0.349	2	-	ND
NAPA	p.H79R	Missense	SNP	0.488	2	-	ND
PRAME	-	-	-	-	1	Loss	ND
PRNP	p.E196G	Missense	SNP	0.107	2	-	ND
RAB36	-	-	-	-	1	Loss	ND
RELN	p.R2955P	Missense	SNP	0.444	2	-	ND
RSPH14	-	-	-	-	1	Loss	ND
ZNF280A	-	-	-	-	1	Loss	ND
ZNF280B	-	-	-	-	1	Loss	ND